Thomas Anderson es un joven pirata informático que lleva una doble vida: durante el día trabaja en una empresa de servicios informáticos y de noche se dedica a piratear bases de datos saltándose sistemas de alta seguridad. Su vida dará un vuelco una noche cuando una misteriosa joven, que parece ser una leyenda en el mundo de los hackers informáticos, le propone presentarle a su líder, Morfeo. Será entonces cuando descubrirá una terrible realidad sobre el mundo dónde vive: una realidad artificial, controlada por las máquinas. Neo tendrá que elegir si unirse a la resistencia para luchar contra la dictadura informática o vivir su falsa vida.